Działalność laboratoryjna w spółce GAZ-SYSTEM to niezmiernie ważny aspekt jej aktywności badawczo-rozwojowej. Obecnie w strukturze Pionu Badań i Rozwoju działają trzy laboratoria akredytowane przez Polskie Centrum Akredytacji na zgodność z Normą PN-EN ISO/IEC 17025:2018-02: Laboratorium Pomiarów Jakości Gazu, Laboratorium Wzorcowania Gazomierzy oraz Laboratorium Badań Materiałowych. W roku 2021 LBM uzyskało również uznanie Urzędu Dozoru Technicznego.
Laboratorium Pomiarów Jakości Gazu zlokalizowane w Pogórskiej Woli (certyfikat akredytacji nr AB 1228), świadczy m.in. usługi poboru próbek gazu, badań składu gazu ziemnego w zakresie podstawowym i rozszerzonym, pomiarów temperatury punktu rosy wody i węglowodorów, kontroli pomiarowo-analitycznej procesowych chromatografów gazowych, pomiarów w środowisku pracy: drgań mechanicznych o działaniu ogólnym i miejscowym, czy hałasu pochodzącego z instalacji lub urządzeń.
Laboratorium realizuje również dodatkowe zadania, jak szkolenia i warsztaty związane z eksploatacją urządzeń do pomiarów parametrów jakościowych paliwa gazowego, badania zawartości związków siarki, w tym THT, pomiarów oświetlenia na stanowisku pracy, zawartości wodoru w gazie ziemnym, czy emisji metanu. Natomiast do podstawowych zadań placówki laboratorium w Świnoujściu należy wykonywanie analiz rozliczeniowych podczas rozładunku tankowców z LNG oraz załadunku LNG do autocystern, zatwierdzanie i weryfikacja danych pomiarowych oraz wykonywanie analiz wody i ścieków na zlecenie służb eksploatacyjnych terminalu.
Z kolei Laboratorium Wzorcowania Gazomierzy (certyfikat akredytacji nr AP 183) należy do wąskiego grona europejskich laboratoriów akredytowanych w zakresie wzorcowania gazomierzy turbinowych. Planowane jest rozszerzenie zakresu akredytacji o wzorcowanie gazomierzy ultradźwiękowych. Laboratorium, poza wzorcowaniem gazomierzy będących w użytkowaniu, wykonuje również wzorcowania na zlecenie producentów gazomierzy, w ramach weryfikacji pierwotnej, związanej z procesem oceny zgodności i wprowadzaniem nowych urządzeń na rynek. Laboratorium jest miejscem interesującym nie tylko dla polskich, ale i dla zagranicznych klientów, zarówno w zakresie wzorcowania, jak i możliwości prowadzenia różnego rodzaju testów i prac badawczo-rozwojowych.
Trzecie laboratorium działające w strukturach GAZ-SYSTEM – Laboratorium Badań Materiałowych (certyfikat akredytacji AB 1767) zajmuje się realizacją takich badań nieniszczących, jak badania wizualne, magnetyczno-proszkowe, penetracyjne, ultradźwiękowe, w tym pomiary grubości ścianki, czy ocena i weryfikacja radiogramów złączy spawanych. W 2021 r. laboratorium uzyskało Uznanie Urzędu Dozoru Technicznego nr LBU-318/25-21.