Od 16 lipca do 15 sierpnia 2012 r. lotnisko obsłużyło 161 tys. 119 pasażerów i wykonało 1 tys. 106 operacji lotniczych. Z lotniska operują linie WizzAir i Ryanair. Według informacji portu, WizzAir obsłużył 118 tys. 956 pasażerów i 782 operacje lotnicze, a Ryanair - 41 tys. 800 pasażerów i 322 operacje lotnicze. Rekord liczby odprawionych osób i rejsów padł w piątek 10 sierpnia, kiedy obsłużono 6 tys. 407 podróżnych. Lotnisko podkreśla, że najwięcej operacji lotniczych (42) odbywa się w każdy piątek.
Z portu lotniczego w Modlinie można obecnie polecieć do 21 miast europejskich: Barcelony, Glasgow, Brukseli, Paryża, Eindhoven, Mediolanu, Liverpoolu, Sztokholmu, Budapesztu, Oslo, Londynu, Rzymu, Forli, Dublina, Stavanger, Bourgas, Cork, Madrytu, Doncaster, Malmo oraz Goeteborga. Od września planowane są połączenia do Bristolu, Manchesteru i Duesseldorfu.
Koszt inwestycji związanej z uruchomieniem Portu Lotniczego Warszawa-Modlin to ok. 250 mln zł. 102 mln zł pochodzi z Programu Operacyjnego Infrastruktura i Środowisko. Unia Europejska przyznała dofinansowanie w wysokości ok. 76 mln zł. Kolejne 168 mln zł unijnej dotacji trafi na zakup 16 elektrycznych pociągów i budowę stacji kolejowej na lotnisku w Modlinie.
Lotniskiem zarządza spółka Mazowiecki Port Lotniczy Warszawa-Modlin. Jej udziałowcami są: Agencja Mienia Wojskowego, województwo mazowieckie, Przedsiębiorstwo Państwowe Porty Lotnicze oraz miasto Nowy Dwór Mazowiecki.